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學(xué)院有草業(yè)科學(xué)、水土保持與荒漠化防治、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、土地資源管理、資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理5個(gè)本科專業(yè)，2005年新增設(shè)生態(tài)保護(hù)與資源利用試點(diǎn)本科專業(yè)。學(xué)院有草業(yè)科學(xué)、水土保持與荒漠化防治、生態(tài)學(xué)、草畜種質(zhì)資源學(xué)、植物營(yíng)養(yǎng)學(xué)、土壤學(xué)、野生動(dòng)植物保護(hù)與利用、土地資源管理8個(gè)碩士學(xué)位授予點(diǎn)；草業(yè)科學(xué)、水土保持與荒漠化防治、土壤學(xué)、野生動(dòng)植物保護(hù)與利用、草畜種質(zhì)資源學(xué)5個(gè)博士學(xué)位授予點(diǎn)，草業(yè)科學(xué)學(xué)科和水土保持與荒漠化防治學(xué)科設(shè)有博士后流動(dòng)站。

學(xué)院下設(shè)草地資源管理、牧草及藥用植物利用、水土保持與荒漠化防治、植物學(xué)、土壤與植物營(yíng)養(yǎng)學(xué)、土地資源管理、資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理7個(gè)教研室；草地資源、牧草生產(chǎn)、土壤學(xué)、植物學(xué)、地理信息系統(tǒng)、沙地生物資源保護(hù)6個(gè)實(shí)驗(yàn)室。學(xué)院設(shè)有教育部與自治區(qū)共建的“草業(yè)與草地資源實(shí)驗(yàn)室”、國(guó)家林業(yè)局開(kāi)放性實(shí)驗(yàn)室“沙地生物資源保護(hù)和培育實(shí)驗(yàn)室”，“內(nèi)蒙古自治區(qū)沙地（沙漠）生態(tài)系統(tǒng)與生態(tài)工程實(shí)驗(yàn)室”和“內(nèi)蒙古自治區(qū)草品種育繁工程技術(shù)研究” 和“內(nèi)蒙古草業(yè)研究院”。2008年國(guó)家財(cái)政部批準(zhǔn)設(shè)立與地方共建高校特色優(yōu)勢(shì)學(xué)科“草地資源與保護(hù)”實(shí)驗(yàn)室；2009年教育部批準(zhǔn)設(shè)立“植物學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范”建設(shè)單位。內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)沙漠治理研究所掛靠在該學(xué)院。在巴彥淖爾市磴口縣中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院沙漠林業(yè)實(shí)驗(yàn)建有內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)實(shí)踐教學(xué)基地；“賽罕烏拉森林生態(tài)系統(tǒng)定位研究站”；在包頭苠仁藥業(yè)公司建有“中（蒙）藥材產(chǎn)、學(xué)、研示范基地，在校內(nèi)、外建有牧草實(shí)驗(yàn)實(shí)習(xí)基地等10個(gè)教學(xué)實(shí)習(xí)基地。